Chùa có tên chữ là Linh Quang tự. Trụ ở số 3 phố Nhà Thờ, cạnh bờ hồ Hoàn Kiếm. Chùa nằm trên một con phố nhỏ và dài chỉ vài trăm mét nhưng hiện diện cả hai hệ ý thức tín ngưỡng Phật giáo và Thiên chúa giáo. Chùa được dựng trên nền tháp Báo Thiên nổi tiếng của kinh thành Thăng Long xưa.
Tương truyền khi đào đất đắp thành Thăng Long vào đời vua Lê Thánh Tông (1460 - 1697)ở làng Báo Thiên Tự Tháp (khu vực Nhà thờ Lớn ngày nay) thì một người dân đã đào được một pho tượng bằng đá hình dáng một phụ nữ (có thuyết cho là một pho tượng Phật Bà bằng đá) cho là thánh mẫu nên đã lập đền thờ ngay tại nơi đào được tượng và gọi là đền Bà Đá. Sau dân làng thấy linh thiêng mới góp công, góp của xây thành chùa lớn, đón sư về trụ trì và thờ phật. Vì vậy chùa có tên là chùa Bà Đá và tên chữ là "Linh Quang tự".
Một số tài liệu khác lại cho rằng, vào thời Pháp thuộc, Đền bị cháy và Pho tượng đá bị mất trong vụ cháy. Sau đó Đền được làm lại và chuyển thành chùa và tạc một pho tượng Phật Thích Ca bằng đá thay thế tượng Bà Đá cũ, chùa mang tên mới là Linh Quang Tự. Bởi vậy không còn nhiều vẻ cổ kính, chỉ còn một số di vật như hai cái chuông đúc năm 1873 và năm 1881, một khánh đồng đúc năm 1842 đều thuộc thời Nguyễn.
Trước kia trong chùa có Tượng Phát Lâm (tượng có nụ cười yêu đời) được coi là một trong tứ khí của Hà Nội.
Chùa vốn là trường sở của phái Lâm Tế trong đạo Phật. Hiện nay chùa là trụ sở chính Thành hội phật giáo Hà Nội. Trong chùa có Trường Trung Cấp Phật Học Hà Nội. Tại chùa hàng năm vẫn thường xuyên là nơi tổ chức các buổi lễ của thành hội phật giáo Hà Nội.
50, Lý Quốc Sư, Phường Hàng Trống, Quận Hoàn Kiếm, Hà Nội
3, Nhà Thờ, Phường Hàng Trống, Quận Hoàn Kiếm, Hà Nội
63, Hàng Trống, Phường Hàng Trống, Quận Hoàn Kiếm, Hà Nội
2A, Ngõ Bảo Khánh, Phường Hàng Trống, Quận Hoàn Kiếm, Hà Nội
22, Ấu Triệu, Phường Hàng Trống, Quận Hoàn Kiếm, Hà Nội